Exscalate Platform e Drug Discovery

Piattaforma Exscalate

Exscalate ha dimostrato di poter accelerare lo sviluppo dei farmaci dall'identificazione e convalida di un bersaglio biologico all'identificazione dei candidati clinici.
La nostra missione è quella di migliorare il tasso di successo clinico attraverso il profilo polifarmacologico dei farmaci grazie a sonde chimiche di altissima qualità sfruttate dall'exascale AI Driven Medicine Design.

Exscalate è una piattaforma di drug discovery che vanta una libreria molecolare composta da 2 trilioni di molecole, che possono essere valutate alla velocità di 60 milioni al secondo per ogni nuovo bersaglio. In parallelo alla progettazione de novo dello screening basato sulla targeted library, abbiamo sviluppato strumenti specifici per il processo di riprogettazione o riposizionamento dei farmaci.

Lo scopo di Exscalate è l'identificazione di molecole con caratteristiche strutturali in grado di interagire con specifici recettori cellulari per innescare specifiche attività biologiche. Il software che utilizziamo ci permette anche di disegnare nuove molecole seguendo le regole del rational drug design per ottenere composti in grado di interagire specificamente con un tessuto o regolare l'attività biologica di una cellula o di una proteina. Le nostre risorse di supercalcolo permettono a Exscalate di condurre uno screening simultaneo su migliaia di bersagli, aprendo la strada a un nuovo approccio "polifarmacologico" alle patologie che hanno alla base una disregolazione di più meccanismi di azione biologici.

La piattaforma comprende tre moduli complementari sviluppati in-house:

• Tangible Chemical Space ("TCS") con 2 trilioni di molecole.
• Therapeutic Target Database ("CTTD")
• LiGen: il più potente simulatore in-silico sul mercato, sviluppato per fornire simulazioni HPC ridurre i tempi e garantire il successo clinico transazionale.

Progetti e partnership

Dompé ha adottato un approccio di collaborazione in ottica Open Innovation, collaborando con aziende, istituzioni e istituti di ricerca, tra cui la Commissione Europea e con spin-off accademici e promettenti aziende biotech.

Engitix: fibrosi e tumori solidi del fegato

Nel 2021, Dompé ha stipulato un accordo di collaborazione strategica di ricerca e sviluppo pluriennale con Engitix per supportare l’identificazione di nuovi trattamenti contro la fibrosi e i tumori solidi associati al fegato.

Aramis Bioscience: dall'identificazione del target al nuovo farmaco sperimentale

Nel 2020 Exscalate ha identificato un lead compound che agisce su un nuovo target per l'indicazione dry eye permettendo ad Aramis Bioscience, una spin off dell'Harvard Medical school, di partire da 0 ed arrivare all'IND approval in fase II per una nuova molecular entity, in soli 14 mesi.

Exscalate4CoV (E4C)

Durante la pandemia, Exscalate ha avuto uno sviluppo importante nel progetto Exscalate4CoV (E4C). Questo consorzio, guidato da Dompé, comprende 18 istituzioni e centri di ricerca pubblici e privati, provenienti da sette diversi Paesi diversi, sostenuti dalla Commissione Europea, nell'ambito del programma quadro Horizon 2020. E4C ha utilizzato la piattaforma per sviluppare nuovi farmaci contro il Covid-19. Questo approccio ha già dato i suoi frutti, con l'identificazione di una molecola che è stata oggetto di una sperimentazione clinica nell'uomo.

Antarex4Zika

La prima convalida dell'approccio di Exscalate è stata ottenuta nell'identificazione di composti attivi contro il virus Zyka.

Hit-to-lead (H2L)

Le molecole selezionate nella fase HTS come quelle che hanno un'attività in vitro migliore rispetto ad altre vengono denominate hit compound. Prima di essere indirizzate alla sperimentazione clinica, queste molecole subiscono un’ulteriore selezione, che dura sei-nove mesi, con l’obiettivo di verificare che siano anche molecole selettive per il target di interesse e che abbiano caratteristiche chimico-fisiche e farmacocinetiche adeguate allo scopo terapeutico previsto (per esempio, la solubilità). In questo modo si individuano i composti più promettenti, denominati lead compound, che verranno avviati alla successiva fase di validazione. Questa prevede una prova di concetto preclinica nel modello animale (ratto, topo, coniglio etc.) rappresentativo della patologia d’interesse e una valutazione tossicologica preliminare, per verificare che il composto non abbia effetti tossici, teratogeni o mutageni. Le molecole che superano tutte le prove, indicate come lead candidate, possono finalmente essere avviate alla fase clinica.